किफिरे जिले के अंतर्गत आने वाला क्षेत्र, तुएनसांग क्षेत्र के हिस्से के रूप में, ‘नॉर्थ ईस्टर्न फ्रंटियर एजेंसी’ (North Eastern Frontier Agency — NEFA) का भाग था। 1920 के दशक में आसपास के क्षेत्रों पर ब्रिटिश शासन स्थापित हो जाने के बावजूद, राज्य का यह हिस्सा ब्रिटिश औपनिवेशिक प्रशासन के प्रभाव से अछूता रहा। हालाँकि, इस क्षेत्र को असम के नागा जनजातीय क्षेत्रों की श्रेणी में शामिल किया गया था और इसे राजनीतिक नियंत्रण के अंतर्गत रखा गया था, लेकिन व्यावहारिक रूप से 1947 में सत्ता हस्तांतरण तक यहाँ न तो राजनीतिक नियंत्रण के स्पष्ट संकेत दिखाई दिए और न ही कोई प्रशासनिक व्यवस्था स्थापित हुई थी। नागरिक प्रशासनिक केंद्रों के विस्तार के क्रम में, वर्ष 1951 में प्रशासनिक मुख्यालय स्थापित करने के लिए सर्वेक्षण किया गया। इस सर्वेक्षण दल का नेतृत्व श्री एच. ज़ोफियांग (H. Zophianga) ने किया, जो उस समय तुएनसांग के उप-आयुक्त के सहायक थे। सर्वेक्षण दल ने वर्तमान किफिरे मुख्यालय का दौरा किया। किफिरे और सिंगरेप गाँवों के लोगों ने प्रशासनिक केंद्र की स्थापना के लिए भूमि दान की। इसके बाद, 16 जून 1952 को किफिरे में दक्षिणी प्रशासनिक केंद्र (Southern Administrative Centre) की स्थापना की गई। श्री एस. डी. लखर (S. D. Lakhar) को इसका पहला बेस एरिया अधीक्षक (Base Area Superintendent) नियुक्त किया गया। किफिरे, तुएनसांग जिले के अंतर्गत एक प्रशासनिक उप-मंडल के रूप में बना रहा। बाद में इसे तुएनसांग जिले से अलग कर दिया गया और 24 जनवरी 2004 को नागालैंड के 11वें जिले के रूप में इसका औपचारिक उद्घाटन किया गया।
